Аналіз синаптичної передачі сигналів на основі кінетичної моделі

Автор(и)

  • O.M. Vasyliev Taras Shevchenko National University of Kyiv
  • O.V. Zaitseva O.O. Bogomolets National Medical University
  • O.V. Chalyi O.O. Bogomolets National Medical University

DOI:

https://doi.org/10.15407/ujpe69.1.37

Ключові слова:

синапс, медiатор, рецептор, екзоцитоз, iмпульс

Анотація

У статтi аналiзуються особливостi передачi нервових сигналiв через синаптичну щiлину (контакт мiж двома нейронами). Вiдповiдний аналiз виконується з використанням кi-нетичної моделi, яка ґрунтується на системi нелiнiйних диференцiальних рiвнянь першого порядку i дозволяє вiдстежувати кiлькiсть активованих рецепторiв на постсинаптичнiй мембранi та кiлькiсть медiатора в синаптичнiй щiлинi. Модель поєднує в собi вiдносну простоту та функцiональнiсть, що дозволяє отримувати якiснi результати, спiвставнi з наявними експериментальними даними та результатами iнших теоретичних дослiджень. Показано, що модель на якiсному рiвнi коректно описує процес проходження сигналу через синаптичну щiлину. Отримано та проаналiзовано точнi (числовi) та наближенi (аналiтичнi) розв’язки для кiлькостi активованих рецепторiв на постсинаптичнiй мембранi та кiлькостi медiатора в синаптичнiй щiлинi. Доведено стiйкiсть стацiонарних станiв в рамках моделi, що свiдчить про самоузгодженiсть останньої i можливiсть її використання для моделювання проходження сигналiв через синапс.

Посилання

A.L. Hodgkin, A.F. Huxley. A quantitative description of membrane current and its application to conduction and 507 excitation in nerve. J. Physiol. 117, 500 (1952).

https://doi.org/10.1113/jphysiol.1952.sp004764

B. Katz, R. Miledi. The measurement of synaptic delay, and the time course of acetylcholine release at the 516 neuromuscular junction. Proc. R. Soc. Lond. B Bio. 161, 483 (1965).

https://doi.org/10.1098/rspb.1965.0016

Z.M. Bacq. Chemical Transmission of Nerve Impulses: A Historical Sketch (Pergamon, 1975).

https://doi.org/10.1016/B978-0-08-020512-0.50009-9

H.W. Davenport. Early history of the concept of chemical transmission of the nerve impulse. Physiologist 34, 129 (1991).

A.V. Chalyi, L.M. Chernenko. Phase transition in finitesize systems and synaptic transmission. In: Dynamical Phenomena at Interfaces, Surfaces, and Membranes (Nowa Science Publishers, 1993), p. 457.

T.C. S¨udhof, R.C. Malenka. Understanding synapses: Past, present, and future. Neuron 60, 469 (2008).

https://doi.org/10.1016/j.neuron.2008.10.011

M.R. Bennett. History of the Synapse (Harwood Academic Publishers, 2001).

https://doi.org/10.4324/9780203302545

S.O. Rizzoli, W.J. Betz. Synaptic vesicle pools. Nature Rev. Neurosci. 6, 57 (2005).

https://doi.org/10.1038/nrn1583

B. Wang, O.K. Dudko. A theory of synaptic transmission. eLife 10, e73585 (2021).

https://doi.org/10.7554/eLife.73585

D.G. Aronson, H.F. Weinberger. Nonlinear diffusion in population genetics, combustion and nerve pulse propagation. In: Partial Differential Equations and Related Topics. Edited by J.A. Goldstein (Springer, 1975), p. XXXXX.

https://doi.org/10.1007/BFb0070595

P. Grindrod. The Theory and Applications of ReactionDiffusion Equations (Clarendon Press, 1996).

D.A. Gavryushenko, K.V. Cherevko, V.M. Sysoev. The influence of the chemical reactions on the diffusion phenomena in the cylincrical systems bounded with the membranes. J. Mol. Liq. 127, 1 (2006).

https://doi.org/10.1016/j.molliq.2006.03.018

K.V. Cherevko, D.A. Gavryushenko, O.V. Korobko, V.M. Sysoev. Entropy production in the diffusion of a Margules solution in a flat-parallel pore. Ukr. J. Phys. 58, 10 (2013).

https://doi.org/10.15407/ujpe58.10.0988

K.V. Cherevko, D.A. Gavryushenko, L.A. Bulavin. Entropy production in a model biological system with facilitated diffusion Ukr. J. Phys. 66, 8 (2021).

https://doi.org/10.15407/ujpe66.8.714

J. Trommershauser, R. Schneggenburger, A. Zippelius, E. Nehery. Heterogeneous presynaptic release probabilities: Functional relevance for short-term plasticity. Biophys. J. 84, 1563 (2003).

https://doi.org/10.1016/S0006-3495(03)74967-4

J. Lichtenberger, P. Fromherz. A cell-semiconductor synapse: Transistor recording of vesicle release in chromaffin cells. Biophys. J. 92, 2266 (2007).

https://doi.org/10.1529/biophysj.106.096446

K. Zheng, A. Scimemi, D.A. Rusakov. Receptor actions of synaptically released glutamate: The role of transporters on the scale from nanometers to microns. Biophys. J. 95, 4584 (2008).

https://doi.org/10.1529/biophysj.108.129874

E. Neher. What is rate-limiting during sustained synaptic activity: Vesicle supply or the availability of release sites. Frontier. Synapt. Neurosci. 2, 144 (2010).

https://doi.org/10.3389/fnsyn.2010.00144

P.S. Kaeser, W.G. Regehr. Molecular mechanisms for synchronous, asynchronous, and spontaneous neurotransmitter release. Annu. Rev. Physiol. 76, 333 (2014).

https://doi.org/10.1146/annurev-physiol-021113-170338

D.H. Kweon, B. Kong, Y.K. Shin. Hemifusion in synaptic vesicle cycle. Frontier. Mol. Neurosci. 10, 65 (2017).

https://doi.org/10.3389/fnmol.2017.00065

M.V. Gramlich, V.A. Klyachko. Nanoscale organization of vesicle release at central synapses. Trend. Neurosci. 42, 425 (2019).

https://doi.org/10.1016/j.tins.2019.03.001

R.W. Holz, S.K. Fisher. Synaptic transmission and cellular signaling: An overview. In: Basic Neurochemistry (Elsevier, 2012), p. 235.

https://doi.org/10.1016/B978-0-12-374947-5.00012-2

A.V. Chalyi, E.V. Zaitseva. Strange attractor in kinetic model of synaptic transmission. J. Phys. Stud. 11, 322 (2007).

https://doi.org/10.30970/jps.11.322

O.V. Chalyi, O.V. Zaitseva. A kinetic model of synaptic transmission on intercell interaction. Ukr. J. Phys. 54, 366 (2009).

A.N. Vasilev, A.V. Chalyi. Cooperative operation mode of a synaptic channel. Ukr. J. Phys. 54, 1183 (2009).

O.M. Vasiliev, S.V. Kyslyak. Two-pool kinetic model of synapse activation. J. Phys. Res. 14, 4801 (2010).

https://doi.org/10.30970/jps.14.4801

SI. Braychenko, O.M. Vasiliev. Modeling the activation of the postsynaptic membrane. J. Phys. Res. 16, 4802 (2012).

https://doi.org/10.30970/jps.16.4802

A.V. Chalyi, A.N. Vasilev, E.V. Zaitseva. Synaptic transmission as a cooperative phenomenon in confined systems. Condens. Matter Phys. 20, 13804 (2017).

https://doi.org/10.5488/CMP.20.13804

O.M. Vasiliev, O.M. Hvyl. Pool model of mediator exocytosis into the synapse. Ukr. J. Phys. 64, 9 (2019).

https://doi.org/10.15407/ujpe64.9.829

O.V. Kulish, A.N. Vasilev. Modeling the nerve impuls transmission in a synaptic cleft. J. Phys. Stud. 23, 1 (2019).

https://doi.org/10.30970/jps.23.1801

S.Yu. Ushcats, M.V. Ushcats, V.M. Sysoev, D.A. Gavryushenko. Approximation of cluster integrals for various lattice-gas models. Ukr. J. Phys. 63, 12 (2019).

https://doi.org/10.15407/ujpe63.12.1066

L.A. Bulavin, K.V. Cherevko, D.A. Gavryushenko, V.M. Sysoev, T.S. Vlasenko. Radiation influence on the temperature-dependent parameters of fluids. Phys. Rev. E 93, 3 (2016).

https://doi.org/10.1103/PhysRevE.93.032133

A.V. Chalyi, A.N. Vasil'ev. Correlation properties, critical parameters and critical light scattering in finite-size systems. J. Mol. Liq. 84, 2 (2000).

https://doi.org/10.1016/S0167-7322(99)00187-7

A.V. Chalyi, K.A. Chaliy, L.M. Chernenko, A.N. Vasil'ev. Critical phenomena in finite-size binary liquid mixtures with reduced geometry. J. Mol. Liq. 93, 1 (2001).

https://doi.org/10.1016/S0167-7322(01)00219-7

Опубліковано

2024-02-06

Як цитувати

Vasyliev, O., Zaitseva, O., & Chalyi, O. (2024). Аналіз синаптичної передачі сигналів на основі кінетичної моделі. Український фізичний журнал, 69(1), 37. https://doi.org/10.15407/ujpe69.1.37

Номер

Розділ

Фізика рідин та рідинних систем, біофізика і медична фізика

Статті цього автора (авторів), які найбільше читають