Спектроскопічні дослідження вірусу інфекційного панкреатичного некрозу, його головного капсидного білка та РНК
DOI:
https://doi.org/10.15407/ujpe64.2.120Ключові слова:
-Анотація
Вiрус iнфекцiйного панкреатичного некрозу (ВIПН) викликає серйознi захворювання риб сiмейства лососевих (форелi, лосося тощо). Вiрiон ВIПН складається з дволанцюгової вiрусної РНК, оточеної бiлковим капсидом. Метою роботи було визначення ролi складових вiрiона ВIПН (капсидних бiлкiв та вiрусної РНК) у формуваннi спектральних властивостей цiлих вiрiонiв. В УФ та видимiй областях спектра було вимiряно спектри поглинання, флюоресценцiї, збудження флюоресценцiї, фосфоресценцiї та збудження фосфоресценцiї вiрiонiв ВIПН, головного капсидного бiлка та вiрусної РНК, розчинених у рiзних буферах. Показано, що поглинання вiрiонiв в УФ областi спектра зумовлене поглинанням як капсидних бiлкiв, так i вiрусної РНК. Флюресценцiя головного капсидного бiлка та цiлих вiрiонiв може бути зумовлена флюоресценцiєю тирозину та тирозину + триптофану вiдповiдно. Низькотемпературна фосфоресценцiя вiрiонiв зумовлена, скорiш за все, фосфоресценцiєю капсидних бiлкiв, а не вiрусної РНК. У спектрi фосфоресценцiї вiрусної РНК спостерiгається електронно-коливальна структура, яка може вiдповiдати аденiну.
Посилання
C. Radloff, R.A. Vaia, J. Brunton et al. Metal nanoshell assembly on a virus bioscaffold. Nano Lett. 5, 1187 (2005). https://doi.org/10.1021/nl050658g
A. Alimova, A. Katz, R. Podder et al. Virus particles monitored by fluorescence spectroscopy: A potential detection assay for macromolecular assembly. Photochem. Photobiol. 80, 41 (2004). https://doi.org/10.1562/2004-02-11-RA-080.1
Going viral. Bioprobes 67, 6 (2012) [http:// lifetechnologies.com].
K. Takemura, O. Adegoke, N. Takahashi et al. Versatility of a localized surface plasmon resonance-based gold nanoparticle-alloyed quantum dot nanobiosensor for immunofluorescence detection of viruses. Biosen. and Bioelectron. 89, 998 (2017). https://doi.org/10.1016/j.bios.2016.10.045
V.M. Yashchuk, V.Yu. Kudrya, S.M. Levchenko et al. Optical response of the polynucleotides-proteins interaction. Mol. Cryst. Liq. Cryst. 535, 93 (2011). https://doi.org/10.1080/15421406.2011.537953
P. Dobos, T.E. Roberts. The molecular biology of infectious pancreatic necrosis virus: a review. Can. J. Microbiol. 29, 377 (1983). https://doi.org/10.1139/m83-062
L. Perez, P.P. Chiou, J.-A.C. Leong. The structural proteins of infectious pancreatic necrosis virus are not glycosylated. J. Virol. 70, 7247 (1996).
S. Lauksund, L. Greiner-Tollersrud, C.-J. Chang, B. Robertsen. Infectious pancreatic necrosis virus proteins VP2, VP3, VP4 and VP5 antagonize IFNa1 promoter activation while VP1 induces IFNa1. Virus Research 196, 113 (2015). https://doi.org/10.1016/j.virusres.2014.11.018
A.K. Dhar, S. LaPatra, A. Orry, F.C.T. Allnutt. Infectious pancreatic necrosis virus. In Fish Viruses and Bacteria: Pathobiology and Protection, edited by P.T.K. Woo and R.C. Cipriano (CABY Publishers, 2017) [ISBN: 9781780647784]. https://doi.org/10.1079/9781780647784.0001
Structural polyprotein. Infectious pancreatic necrosis virus (strain Jasper) (IPNV) [http://www.uniprot.org/uniprot/P05844].
Yu.P. Rud, M.I. Maistrenko, L.P. Buchatskiy. Characterization of an infectious pancreatic necrosis virus from rainbow trout fry (Onhorhynchus mykiss) in West Ukraine. Virologica Sinica 30, 231 (2015). https://doi.org/10.1007/s12250-014-3513-z
Purify proteins from polyacrylamide gels. Thermal Scientific. Tech. tip # 51 [www.thermo.com/pierce].
M. Tanaka, S. Nagakura. Electronic structures and spectra of adenine and thymine. Theoret. Chim. Acta (Berl.) 6, 320 (1966). https://doi.org/10.1007/BF00537278
V.M. Kravchenko, Yu.P. Rud, L.P. Buchatski et al. Spectroscopic studies of mosquito iridescent virus, its capsid proteins, lipids and DNA. Ukr. J. Phys. 57, 183 (2012).
P.G. Kostyuk, D.M. Grodzinsky, V.L. Zima et al. Biophysics (Vyshcha Shkola, 1988) (in Russian).
J.R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy (Springer Science+Business Media, 2006) [ISBN-10: 0-387-31278-1, ISBN-13: 978-0387-31278-1].
V.M. Yashchuk, V.Yu. Kudrya, V.M. Kravchenko, M.Yu. Losytskyy. Introduction to Biophotonics (Chetverta Khvylya, 2018) (in Ukrainian).
T. Truong, R. Bersohn, P. Brumer et al. Effect of pH on the phosphorescence of tryptophan, tyrosine, and proteins. J. Biol. Chem. 242, 2979 (1967).
Varian Cary Eclipse fluorescence spectrophotometer. User's manual.
Downloads
Опубліковано
Як цитувати
Номер
Розділ
Ліцензія
Ліцензійний Договір
на використання Твору
м. Київ, Україна
Відповідальний автор та співавтори (надалі іменовані як Автор(и)) статті, яку він (вони) подають до Українського фізичного журналу, (надалі іменована як Твір) з одного боку та Інститут теоретичної фізики імені М.М. Боголюбова НАН України в особі директора (надалі – Видавець) з іншого боку уклали даний Договір про таке:
1. Предмет договору.
Автор(и) надає(ють) Видавцю безоплатно невиключні права на використання Твору (наукового, технічного або іншого характеру) на умовах, визначених цим Договором.
2. Способи використання Твору.
2.1. Автор(и) надає(ють) Видавцю право на використання Твору таким чином:
2.1.1. Використовувати Твір шляхом його видання в Українському фізичному журналі (далі – Видання) мовою оригіналу та в перекладі на англійську (погоджений Автором(ами) і Видавцем примірник Твору, прийнятого до друку, є невід’ємною частиною Ліцензійного договору).
2.1.2. Переробляти, адаптувати або іншим чином змінювати Твір за погодженням з Автором(ами).
2.1.3. Перекладати Твір у випадку, коли Твір викладений іншою мовою, ніж мова, якою передбачена публікація у Виданні.
2.2. Якщо Автор(и) виявить(лять) бажання використовувати Твір в інший спосіб, як то публікувати перекладену версію Твору (окрім випадку, зазначеного в п. 2.1.3 цього Договору); розміщувати повністю або частково в мережі Інтернет; публікувати Твір в інших, у тому числі іноземних, виданнях; включати Твір як складову частину інших збірників, антологій, енциклопедій тощо, то Автор(и) мають отримати на це письмовий дозвіл від Видавця.
3. Територія використання.
Автор(и) надає(ють) Видавцю право на використання Твору способами, зазначеними у п.п. 2.1.1–2.1.3 цього Договору, на території України, а також право на розповсюдження Твору як невід’ємної складової частини Видання на території України та інших країн шляхом передплати, продажу та безоплатної передачі третій стороні.
4. Строк, на який надаються права.
4.1. Договір є чинним з дати підписання та діє протягом усього часу функціонування Видання.
5. Застереження.
5.1. Автор(и) заявляє(ють), що:
– він/вона є автором (співавтором) Твору;
– авторські права на даний Твір не передані іншій стороні;
– даний Твір не був раніше опублікований і не буде опублікований у будь-якому іншому виданні до публікації його Видавцем (див. також п. 2.2);
– Автор(и) не порушив(ли) права інтелектуальної власності інших осіб. Якщо у Творі наведені матеріали інших осіб за виключенням випадків цитування в обсязі, виправданому науковим, інформаційним або критичним характером Твору, використання таких матеріалів здійснене Автором(ами) з дотриманням норм міжнародного законодавства і законодавства України.
6. Реквізити і підписи сторін.
Видавець: Інститут теоретичної фізики імені М.М. Боголюбова НАН України.
Адреса: м. Київ, вул. Метрологічна 14-б.
Автор: Електронний підпис від імені та за погодження всіх співавторів.
.png){kind=small}
